Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA3P42263 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA3P42263 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms