Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms