Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms