Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms