Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF4P34130 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF4P34130 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms