Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms