Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA1P25786 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms