Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms