Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NFYAP23511 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NFYAP23511 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NFYAP23511 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NFYAP23511 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NFYAP23511 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms