Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR4A1P22736 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms