Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms