Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC1P15941 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC1P15941 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MUC1P15941 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms