Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX7O95931 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms