Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24BO95487 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24BO95487 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24BO95487 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms