Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATE1O95260 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATE1O95260 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATE1O95260 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATE1O95260 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms