Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms