Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGFO15240 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGFO15240 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGFO15240 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGFO15240 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VGFO15240 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGFO15240 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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