Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP9YO00507 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP9YO00507 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP9YO00507 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP9YO00507 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP9YO00507 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP9YO00507 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP9YO00507 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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