Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIP1O00291 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIP1O00291 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIP1O00291 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIP1O00291 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIP1O00291 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIP1O00291 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIP1O00291 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIP1O00291 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIP1O00291 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIP1O00291 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms