Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFFAO00273 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms