Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA8SH3BPF8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms