Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms