Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms