Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MEIS3P1A6NDR6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEIS3P1A6NDR6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms