Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms