Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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