Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms