Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG7Q9UQ90 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG7Q9UQ90 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms