Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSEQ9UL01 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSEQ9UL01 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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