Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms