Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms