Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms