Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms