Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms