Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms