Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms