Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC90BQ9GZT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms