Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms