Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms