Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms