Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM208Q9BTX3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms