Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS4Q9BT78 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms