Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms