Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms