Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms