Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBP4Q96PP9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms