Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms