Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms