Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms