Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCC12Q96J65 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms